EL NUEVO MILENIO

El nuevo milenio ha sido una época de contraste para el América. Aunque el equipo ha logrado grandes triunfos (entre ellos 4 títulos -2000, 2001, 2002-I, 2008-II-, 1 subtítulo -2008-I- y destacadas participaciones en torneos internacionales, especialmente al inicio del milenio), la institución sigue sumida en una profunda crisis económica, debido en gran parte a las restricciones de la Lista Clinton, cosa que ha tenido repercusiones en lo deportivo (provocando que América haya estado cerca del descenso en 2007 y comience con un puntaje muy bajo en 2010). El principal fuerte del equipo escarlata ha sido su cantera, de la cual han salido jugadores que han sido importantes en las diversas campañas americanas a lo largo de la primera década del nuevo milenio.

2000: En la temporada, fue segundo del Torneo Apertura; primero del Torneo Finalización y con éste obtuvo un cupo para la Copa Libertadores de América. En el cuadrangular final obtuvo el primer lugar que lo coronó como campeón del torneo colombiano por décima vez. El último partido fue contra el Deportes Tolima, donde América ganó por 2-0 con goles de Luis Asprilla y Néstor Salazar. En la Copa Libertadores de ese año, América se enfrentó al Rosario Central de Argentina, Sporting Cristal de Perú y Atlético Colegiales de Paraguay. Pasa la primera fase con 16 puntos. En la fase de octavos se enfrenta al América de México, y queda eliminado tras perder 2-1 en México y 3-2 en Bogotá. Cabe destacar que los partidos de América como local en la Copa se jugaron en el Estadio El Campín de Bogotá, debido a las reparaciones que se le efectuaban al Estadio Olímpico Pascual Guerrero.
2001: América se coronó campeón por undécima vez después de ganarle 3-0 en el marcador global al Deportivo Independiente Medellín. En el partido de ida en Medellín, América ganó 0-1 y en el partido de vuelta ganó 2-0 con goles de Edison "Guigo" Mafla y Julián Vásquez. El "Guigo" fue la figura de ese partido por el golazo de tiro libre que anotó y también por la asistencia que le hizo a Julián Vásquez para el segundo gol;[41] En Copa Libertadores también se hizo buena campaña y se llegó a cuartos de final. Finalmente los rojos fueron eliminados por Rosario Central en definición desde el punto penal, donde de nada sirvió el gran esfuerzo del arquero Americano Luis Barbat que detuvo varios penales.
2002: En el primer "torneo corto", América logró su decimosegunda estrella en el Estadio Atanasio Girardot contra el Atlético Nacional. Con este campeonato consiguió el tricampeonato (tres títulos consecutivos) bajo la dirección técnica de Jaime de la Pava y de esa forma se convirtió en el único equipo en tener un pentacampeonato y un tricampeonato. En la Copa Libertadores 2002, América enfrenta al Bolivar de Bolivia, Olmedo de Ecuador y Atlético Paranaense de Brasil. Pasa la primera fase como líder del grupo. En la fase de octavos, América enfrenta al Nacional de Uruguay y pierde 1-0 en Montevideo y empata 0-0 en Cali, quedando por fuera del torneo. En la Copa Sudamericana de ese año, enfrenta al Atlético Nacional y queda eliminado en la primera fase, tras perder con el club colombiano.
2003: El América participo de nuevo en Copa Libertadores y otra vez llego hasta las semifinales. En octavos, el América venció al Racing de Avellaneda desde el punto penal en el partido de vuelta en Argentina. El arquero del América, Róbinson Zapata, se convirtió en el héroe de la noche después de tapar el último penal de Racing y convertir el del América. En cuartos de final el rival fue River Plate de Argentina, equipo que le gano dos finales de Copa Libertadores al América de Cali. En el partido de ida, River gano 2-1 por un gol anotado en tiempo extra del segundo tiempo. En el partido de vuelta en Cali el América goleo 4-1 a River Plate y paso a disputar la semifinal, donde fue eliminado por Boca Juniors.
2004: Dirigido por Alberto Suárez que llegaba al equipo como técnico promovedor de jugadores de las inferiores, América realizo excelente campaña en el torneo Apertura clasificando en primer lugar pero decepcionando en la disputa por el título,[42] en el finalización lograría una campaña muy similar quedando resagado de la final y terminando tercero[42] lo importante de la campaña es que gana la reclasificacion y se clasifica con lujo de detalles a la Copa Libertadores 2005.
2005: Es otro buen año para el América, ya que clasifica en el Torneo Finalización a la fase de cuadrangulares, pero no clasifica a torneo internacional. Ya en la Copa Libertadores de ese año, América enfrentó en la fase previa, al Mineros de Venezuela, y tras vencerlo, pasa a la fase de grupos donde enfrentó al Libertad de Paraguay, Independiente Medellín y Atlético Paranaense de Brasil. América quedó eliminado del torneo en la primera fase.
2007: Luego de tres torneos sin lograr el ingreso a los cuadrangulares semifinales del Fútbol Colombiano (la última vez había sido en el segundo semestre de 2005) el América logró clasificar, al quedar de tercero en la ronda de todos contra todos en el Torneo Finalización 2007 bajo la dirección técnica de Diego Edison Umaña, quien tomó las riendas del equipo a mediados de año. Gracias a su buen trabajo, el elenco 'escarlata' alcanzó un cupo para la Copa Sudamericana 2008, junto al Deportivo Cali, su rival de patio. Gracias a su buena actuación, los directivos americanos extendieron el contrato de Diego Umaña de mediados de 2008, como estaba pactado inicialmente, hasta diciembre del mismo año.[43] [44]
2008: En la pretemporada, América es campeón de la Copa Internacional Cafam 50 años, ganando el primer partido contra Santa Fe desde el punto penal y posteriormente ganando la final contra Millonarios 0-1,[45]
En el Torneo Apertura América logró una de sus mejores campañas desde el título obtenido en 2002 clasificándose hasta la final, la cual perdió ante el sorprendente Boyacá Chicó en la tanda de penales 4-2 luego de empatar la serie 2-2 frustrando el 13 título del equipo. América terminó en la clasificación de segundo con 40 puntos. Como dato curioso, decir que durante este torneo el cuadro rojo logró la víctoria más amplia del Clásico Vallecaucano en la última década, con un 4 a 0 el sabado 23 de marzo.[46]
Asimismo, disputó la Copa Sudamericana 2008, eliminando en primera fase al Unión Atlético Maracaibo, luego a su rival de plaza, el Deportivo Cali. En octavos de final, el América es eliminado por el Botafogo de Brasil tras vencerlos 1-0 en el partido de ida desarrollado en Cali, pero pierde por 3-1 en condición de visitante.
El 21 de diciembre, América de Cali se coronó por 13ª vez campeón de Colombia al obtener el Torneo Finalización, luego de superar en una final vibrante al Independiente Medellín. El marcador agregado fue 4-1 a favor del equipo 'Escarlata'. Con esta victoria, América igualó el número de títulos de Millonarios.
2009: América tuvo un pésimo año, tanto en lo deportivo como en lo económico (la institución le llegó a deber 10 quincenas a los jugadores[47] ). En el Torneo Apertura quedó por fuera de los cuadrangulares semifinales, tras ocupar el 13º lugar. Asimismo, fue eliminado de la fase de grupos de la Copa Libertadores 2009, tras quedar en el último lugar con 3 puntos, producto de 3 empates y 3 derrotas.
En el Torneo Finalización, su campaña fue peor que la del primer semestre, debido a que ocupó el penúltimo lugar de la tabla y por consiguiente no avanzó a los cuadrangulares. El equipo culminó último de la reclasificación del año. Debido a los malos resultados y a las malas relaciones con la junta directiva, Diego Umaña fue retirado de la dirección técnica del América.[48] Su reemplazo para el próximo año es Juan Carlos Grueso, quien se estaba desempeñando como técnico interino tras la salida de Umaña.[47]